GO Terms Classification Count Results
For Zhiliang Hu on July 06, 2008 (Sunday, 03:39:42 PM, CDT):Counts:
Below is the mapping of your 2716 GO terms to 71 of the "GOA2GO" ancestor terms. Refer to FAQ for hints on possible interpretation of the results and/or to further improve your analysis.
| GO Class ID | Definitions | Counts | Fractions |
|---|---|---|---|
| GO:0008150 | biological_process | 971 | 12.90% |
| GO:0003674 | molecular_function | 780 | 10.36% |
| GO:0005575 | cellular_component | 728 | 9.67% |
| GO:0009987 | cellular process | 632 | 8.39% |
| GO:0005623 | cell | 589 | 7.82% |
| GO:0005488 | binding | 354 | 4.70% |
| GO:0005622 | intracellular | 290 | 3.85% |
| GO:0008152 | metabolism | 250 | 3.32% |
| GO:0016020 | membrane | 238 | 3.16% |
| GO:0003824 | catalytic activity | 207 | 2.75% |
| GO:0005515 | protein binding | 192 | 2.55% |
| GO:0007154 | cell communication | 179 | 2.38% |
| GO:0005737 | cytoplasm | 161 | 2.14% |
| GO:0043170 | macromolecule metabolism | 158 | 2.10% |
| GO:0050896 | response to stimulus | 149 | 1.98% |
| GO:0005576 | extracellular region | 137 | 1.82% |
| GO:0050789 | regulation of biological process | 120 | 1.59% |
| GO:0004871 | signal transducer activity | 110 | 1.46% |
| GO:0007275 | development | 96 | 1.27% |
| GO:0016787 | hydrolase activity | 84 | 1.12% |
| GO:0005615 | extracellular space | 75 | 1.00% |
| GO:0006139 | nucleobase, nucleoside, nucleotide and nucleic acid metabolism | 75 | 1.00% |
| GO:0006810 | transport | 74 | 0.98% |
| GO:0004872 | receptor activity | 74 | 0.98% |
| GO:0005634 | nucleus | 68 | 0.90% |
| GO:0005215 | transporter activity | 59 | 0.78% |
| GO:0016740 | transferase activity | 58 | 0.77% |
| GO:0003676 | nucleic acid binding | 58 | 0.77% |
| GO:0030154 | cell differentiation | 46 | 0.61% |
| GO:0005198 | structural molecule activity | 46 | 0.61% |
| GO:0030528 | transcription regulator activity | 45 | 0.60% |
| GO:0016301 | kinase activity | 38 | 0.50% |
| GO:0016491 | oxidoreductase activity | 38 | 0.50% |
| GO:0015075 | ion transporter activity | 33 | 0.44% |
| GO:0005578 | extracellular matrix (sensu Metazoa) | 30 | 0.40% |
| GO:0005694 | chromosome | 28 | 0.37% |
| GO:0030234 | enzyme regulator activity | 28 | 0.37% |
| GO:0008219 | cell death | 28 | 0.37% |
| GO:0007610 | behavior | 26 | 0.35% |
| GO:0009058 | biosynthesis | 25 | 0.33% |
| GO:0006519 | amino acid and derivative metabolism | 23 | 0.31% |
| GO:0009056 | catabolism | 23 | 0.31% |
| GO:0006928 | cell motility | 21 | 0.28% |
| GO:0015267 | channel or pore class transporter activity | 18 | 0.24% |
| GO:0005489 | electron transporter activity | 15 | 0.20% |
| GO:0005386 | carrier activity | 9 | 0.12% |
| GO:0004386 | helicase activity | 7 | 0.09% |
| GO:0016874 | ligase activity | 6 | 0.08% |
| GO:0016829 | lyase activity | 5 | 0.07% |
| GO:0016853 | isomerase activity | 5 | 0.07% |
| GO:0003774 | motor activity | 4 | 0.05% |
| GO:0046903 | secretion | 4 | 0.05% |
| GO:0009986 | cell surface | 3 | 0.04% |
| GO:0030188 | chaperone regulator activity | 3 | 0.04% |
| GO:0006118 | electron transport | 2 | 0.03% |
| GO:0043062 | extracellular structure organization and biogenesis | 2 | 0.03% |
| GO:0008565 | protein transporter activity | 2 | 0.03% |
| GO:0016209 | antioxidant activity | 1 | 0.01% |
| Total | 7530 | 100.00% | |
Counted Terms
768 unique terms from your data set are found belonging to at least one of the 58 "GOA2GO" classes
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Odd Terms
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You are welcome to cite the use of this tool:
Zhiliang Hu (2006)
"GO Terms Classification Counter by Transitive Closure".
URL: http://www.animalgenome.org/bioinfo/tools/catego/
Created: September 12, 2005; Last updated: April 26, 2007.