Authors:
McClure MC, Morsci NS, Schnabel RD, Kim JW, Yao P, Rolf MM, McKay SD, Gregg SJ, Chapple RH, Northcutt SL, Taylor JF.
Affiliation:
Division of Animal Sciences, University of Missouri, Columbia
Title:
A genome scan for quantitative trait loci influencing carcass, post-natal growth and reproductive traits in commercial Angus cattle.
Journal:
Animal Genetics, 41 (6): 597-607 (2010)
DOI :
10.1111/j.1365-2052.2010.02063.x
Links:
PubMed | Abstract
| Copy data link
( Related study: none )
Click on each trait to browse further along the related trait ontology tree
Click on each chromosome number to find the detailed QTL information on that chromosome
Number of QTL/association reported by traits:
QTL for Body weight reported for chromosome(s):
Chr.1 : QTL:10654 , QTL:10648 , QTL:10647 , QTL:10645 , QTL:10642 , QTL:10640 , QTL:10639 , QTL:10638 , QTL:10635 , QTL:10631 , QTL:10630 . Chr.2 : QTL:10674 , QTL:10671 , QTL:10670 , QTL:10664 , QTL:10659 , QTL:10658 , QTL:10656 . Chr.3 : QTL:10702 , QTL:10698 , QTL:10697 , QTL:10694 , QTL:10693 , QTL:10692 , QTL:10689 , QTL:10685 , QTL:10684 , QTL:10681 , QTL:10679 , QTL:10678 . Chr.4 : QTL:10720 , QTL:10716 , QTL:10715 , QTL:10714 , QTL:10711 , QTL:10710 , QTL:10708 , QTL:10704 . Chr.5 : QTL:10750 , QTL:10747 , QTL:10746 , QTL:10742 , QTL:10743 , QTL:10740 , QTL:10739 , QTL:10737 , QTL:10724 . Chr.6 : QTL:10772 , QTL:10771 , QTL:10768 , QTL:10766 , QTL:10765 , QTL:10762 , QTL:10757 , QTL:10760 . Chr.7 : QTL:10815 , QTL:10814 , QTL:10810 , QTL:10808 , QTL:10807 , QTL:10803 , QTL:10802 , QTL:10797 , QTL:10796 , QTL:10794 , QTL:10793 , QTL:10792 , QTL:10791 , QTL:10786 , QTL:10783 , QTL:10780 . Chr.8 : QTL:10842 , QTL:10841 , QTL:10840 , QTL:10832 , QTL:10827 , QTL:10825 , QTL:10821 . Chr.9 : QTL:10862 , QTL:10859 , QTL:10856 , QTL:10852 , QTL:10851 , QTL:10847 , QTL:10846 , QTL:10845 . Chr.10 : QTL:10883 , QTL:10880 , QTL:10878 , QTL:10872 , QTL:10873 , QTL:10868 , QTL:10867 , QTL:10864 . Chr.11 : QTL:10912 , QTL:10911 , QTL:10908 , QTL:10905 , QTL:10904 , QTL:10902 , QTL:10900 , QTL:10899 , QTL:10898 , QTL:10896 , QTL:10894 , QTL:10888 , QTL:10887 , QTL:10886 , QTL:10884 . Chr.12 : QTL:10934 , QTL:10933 , QTL:10932 , QTL:10930 , QTL:10929 , QTL:10927 , QTL:10926 , QTL:10924 , QTL:10923 , QTL:10922 , QTL:10918 . Chr.13 : QTL:10949 , QTL:10946 , QTL:10944 , QTL:10939 , QTL:10937 . Chr.14 : QTL:10978 , QTL:10977 , QTL:10970 , QTL:10967 , QTL:10963 , QTL:10955 , QTL:10954 . Chr.15 : QTL:11004 , QTL:11003 , QTL:11002 , QTL:10997 , QTL:10998 , QTL:10996 , QTL:10992 , QTL:10990 , QTL:10989 , QTL:10986 , QTL:10983 , QTL:10982 , QTL:10981 . Chr.16 : QTL:11036 , QTL:11031 , QTL:11028 , QTL:11026 , QTL:11025 , QTL:11023 , QTL:11019 , QTL:11017 , QTL:11016 , QTL:11013 , QTL:11011 . Chr.17 : QTL:11056 , QTL:11054 , QTL:11050 , QTL:11047 , QTL:11045 , QTL:11042 , QTL:11041 , QTL:11039 , QTL:11038 . Chr.18 : QTL:11069 , QTL:11066 , QTL:11065 , QTL:11064 , QTL:11063 , QTL:11061 , QTL:11057 . Chr.19 : QTL:11089 , QTL:11086 , QTL:11083 , QTL:11082 , QTL:11079 , QTL:11075 , QTL:11076 , QTL:11074 , QTL:11072 , QTL:11071 . Chr.20 : QTL:11112 , QTL:11104 , QTL:11103 , QTL:11102 , QTL:11101 , QTL:11100 , QTL:11099 , QTL:11097 , QTL:11096 . Chr.21 : QTL:11130 , QTL:11128 , QTL:11127 , QTL:11123 , QTL:11121 , QTL:11116 . Chr.22 : QTL:11156 , QTL:11151 , QTL:11149 , QTL:11142 , QTL:11140 , QTL:11139 . Chr.23 : QTL:11180 , QTL:11177 , QTL:11176 , QTL:11174 , QTL:11171 , QTL:11169 , QTL:11166 , QTL:11164 , QTL:11161 , QTL:11163 . Chr.24 : QTL:11198 , QTL:11199 , QTL:11197 , QTL:11193 , QTL:11188 , QTL:11184 . Chr.25 : QTL:11218 , QTL:11215 , QTL:11212 , QTL:11213 , QTL:11211 , QTL:11209 , QTL:11205 , QTL:11206 , QTL:11207 , QTL:11203 , QTL:11201 . Chr.26 : QTL:11242 , QTL:11241 , QTL:11237 , QTL:11236 , QTL:11234 , QTL:11233 , QTL:11232 , QTL:11231 , QTL:11230 , QTL:11223 , QTL:11221 . Chr.27 : QTL:11262 , QTL:11254 , QTL:11249 , QTL:11248 , QTL:11247 , QTL:11246 . Chr.28 : QTL:11281 , QTL:11278 , QTL:11274 , QTL:11273 , QTL:11267 , QTL:11266 . Chr.29 : QTL:11301 , QTL:11299 , QTL:11298 , QTL:11296 , QTL:11294 , QTL:11293 .
QTL for Marbling score reported for chromosome(s):
Chr.1 : QTL:10641 , QTL:10636 , QTL:10632 . Chr.2 : QTL:10673 , QTL:10669 , QTL:10666 , QTL:10663 , QTL:10657 . Chr.3 : QTL:10700 . Chr.4 : QTL:10707 . Chr.5 : QTL:10749 , QTL:10744 , QTL:10734 , QTL:10728 , QTL:10723 . Chr.6 : QTL:10777 , QTL:10770 , QTL:10756 , QTL:10758 . Chr.7 : QTL:10812 , QTL:10799 , QTL:10790 , QTL:10781 . Chr.8 : QTL:10837 , QTL:10824 , QTL:10823 , QTL:10818 . Chr.9 : QTL:10861 , QTL:10860 , QTL:10850 . Chr.10 : QTL:10877 , QTL:10874 . Chr.11 : QTL:10909 , QTL:10901 , QTL:10891 . Chr.12 : QTL:10919 . Chr.13 : QTL:10950 , QTL:10947 , QTL:10941 . Chr.14 : QTL:10952 . Chr.15 : QTL:10999 , QTL:10980 . Chr.16 : QTL:11012 , QTL:11008 . Chr.17 : QTL:11049 . Chr.18 : QTL:11059 . Chr.19 : QTL:11090 , QTL:11085 , QTL:11080 , QTL:11077 . Chr.20 : QTL:11111 . Chr.21 : QTL:11129 . Chr.22 : QTL:11146 , QTL:11138 . Chr.23 : QTL:11179 , QTL:11173 . Chr.24 : QTL:11200 , QTL:11189 , QTL:11183 . Chr.25 : QTL:11202 . Chr.26 : QTL:11238 , QTL:11229 , QTL:11222 . Chr.27 : QTL:11258 , QTL:11253 , QTL:11243 . Chr.28 : QTL:11270 . Chr.29 : QTL:11300 , QTL:11288 .
QTL for Body height reported for chromosome(s):
Chr.1 : QTL:10637 . Chr.3 : QTL:10691 , QTL:10688 , QTL:10686 , QTL:10683 . Chr.4 : QTL:10719 , QTL:10712 , QTL:10709 , QTL:10705 . Chr.5 : QTL:10745 , QTL:10738 , QTL:10736 , QTL:10727 , QTL:10726 . Chr.6 : QTL:10774 , QTL:10767 . Chr.7 : QTL:10813 , QTL:10788 . Chr.8 : QTL:10835 , QTL:10830 , QTL:10828 , QTL:10820 . Chr.10 : QTL:10875 , QTL:10866 . Chr.12 : QTL:10928 , QTL:10925 , QTL:10916 , QTL:10915 . Chr.14 : QTL:10972 , QTL:10962 , QTL:10953 . Chr.15 : QTL:11001 , QTL:10993 , QTL:10979 . Chr.16 : QTL:11034 , QTL:11018 , QTL:11010 . Chr.18 : QTL:11068 . Chr.19 : QTL:11088 . Chr.20 : QTL:11106 , QTL:11105 . Chr.21 : QTL:11133 , QTL:11132 , QTL:11122 , QTL:11120 . Chr.22 : QTL:11155 , QTL:11147 , QTL:11144 . Chr.23 : QTL:11159 , QTL:11157 . Chr.24 : QTL:11194 . Chr.25 : QTL:11216 . Chr.26 : QTL:11239 , QTL:11228 , QTL:11226 , QTL:11219 . Chr.27 : QTL:11255 , QTL:11251 . Chr.28 : QTL:11277 , QTL:11271 , QTL:11268 . Chr.29 : QTL:11295 , QTL:11290 .
QTL for Carcass weight reported for chromosome(s):
Chr.1 : QTL:10651 . Chr.2 : QTL:10672 , QTL:10668 , QTL:10665 , QTL:10660 , QTL:10655 . Chr.3 : QTL:10699 , QTL:10696 , QTL:10687 , QTL:10682 , QTL:10677 , QTL:10675 . Chr.5 : QTL:10752 , QTL:10730 . Chr.6 : QTL:10779 , QTL:10773 . Chr.7 : QTL:10809 , QTL:10805 , QTL:10800 , QTL:10784 . Chr.8 : QTL:10834 , QTL:10826 , QTL:10817 . Chr.9 : QTL:10843 . Chr.10 : QTL:10881 , QTL:10876 , QTL:10869 . Chr.11 : QTL:10907 , QTL:10895 , QTL:10890 . Chr.12 : QTL:10931 . Chr.13 : QTL:10938 . Chr.14 : QTL:10974 , QTL:10969 , QTL:10966 , QTL:10960 . Chr.15 : QTL:11006 , QTL:10994 , QTL:10985 . Chr.16 : QTL:11022 , QTL:11009 . Chr.17 : QTL:11048 , QTL:11040 . Chr.20 : QTL:11107 , QTL:11098 , QTL:11094 . Chr.21 : QTL:11135 , QTL:11124 , QTL:11115 . Chr.22 : QTL:11145 , QTL:11137 . Chr.23 : QTL:11178 , QTL:11168 , QTL:11162 . Chr.24 : QTL:11195 , QTL:11190 , QTL:11185 . Chr.25 : QTL:11210 . Chr.26 : QTL:11235 , QTL:11224 . Chr.27 : QTL:11257 , QTL:11252 , QTL:11245 . Chr.28 : QTL:11272 , QTL:11265 . Chr.29 : QTL:11297 , QTL:11292 , QTL:11287 , QTL:11283 .
QTL for Subcutaneous fat thickness reported for chromosome(s):
Chr.1 : QTL:10653 , QTL:10649 . Chr.2 : QTL:10661 . Chr.3 : QTL:10701 . Chr.4 : QTL:10717 . Chr.5 : QTL:10751 , QTL:10733 , QTL:10731 , QTL:10725 . Chr.6 : QTL:10778 , QTL:10761 , QTL:10755 . Chr.7 : QTL:10804 , QTL:10801 . Chr.8 : QTL:10816 . Chr.9 : QTL:10844 . Chr.11 : QTL:10903 , QTL:10892 . Chr.12 : QTL:10920 . Chr.13 : QTL:10945 , QTL:10943 , QTL:10936 . Chr.14 : QTL:10976 , QTL:10973 , QTL:10971 , QTL:10965 , QTL:10961 , QTL:10957 . Chr.15 : QTL:10984 . Chr.16 : QTL:11035 , QTL:11032 , QTL:11020 , QTL:11014 . Chr.17 : QTL:11052 , QTL:11046 , QTL:11044 . Chr.18 : QTL:11058 . Chr.19 : QTL:11070 . Chr.20 : QTL:11109 . Chr.21 : QTL:11125 , QTL:11118 , QTL:11114 . Chr.22 : QTL:11152 . Chr.23 : QTL:11175 , QTL:11172 , QTL:11160 . Chr.24 : QTL:11192 , QTL:11187 . Chr.25 : QTL:11217 . Chr.27 : QTL:11261 , QTL:11250 . Chr.28 : QTL:11269 , QTL:11264 . Chr.29 : QTL:11291 , QTL:11286 , QTL:11282 .
QTL for Longissimus muscle area reported for chromosome(s):
Chr.1 : QTL:10652 , QTL:10650 , QTL:10643 . Chr.3 : QTL:10690 , QTL:10680 , QTL:10676 . Chr.5 : QTL:10748 , QTL:10735 , QTL:10729 . Chr.6 : QTL:10776 , QTL:10763 , QTL:10754 . Chr.7 : QTL:10806 , QTL:10798 , QTL:10785 . Chr.8 : QTL:10836 , QTL:10829 , QTL:10819 . Chr.9 : QTL:10857 , QTL:10849 . Chr.10 : QTL:10865 . Chr.11 : QTL:10913 , QTL:10910 , QTL:10897 , QTL:10893 . Chr.12 : QTL:10921 . Chr.13 : QTL:10951 , QTL:10948 , QTL:10942 , QTL:10935 . Chr.14 : QTL:10968 , QTL:10964 . Chr.15 : QTL:11005 , QTL:10995 , QTL:10987 . Chr.16 : QTL:11033 , QTL:11027 , QTL:11024 , QTL:11021 . Chr.17 : QTL:11053 , QTL:11037 . Chr.18 : QTL:11062 , QTL:11060 . Chr.19 : QTL:11093 , QTL:11084 . Chr.20 : QTL:11110 . Chr.21 : QTL:11134 , QTL:11119 . Chr.22 : QTL:11154 , QTL:11136 . Chr.23 : QTL:11165 . Chr.24 : QTL:11186 , QTL:11182 . Chr.26 : QTL:11220 . Chr.27 : QTL:11256 , QTL:11244 . Chr.28 : QTL:11263 . Chr.29 : QTL:11289 , QTL:11284 .
QTL for Scrotal circumference reported for chromosome(s):
Chr.1 : QTL:10644 . Chr.4 : QTL:10718 , QTL:10706 . Chr.5 : QTL:10753 , QTL:10722 . Chr.6 : QTL:10775 . Chr.7 : QTL:10789 , QTL:10787 , QTL:10782 . Chr.8 : QTL:10822 . Chr.9 : QTL:10863 , QTL:10858 , QTL:10854 . Chr.10 : QTL:10882 , QTL:10879 . Chr.11 : QTL:10906 , QTL:10889 , QTL:10885 . Chr.12 : QTL:10917 . Chr.13 : QTL:10940 . Chr.14 : QTL:10975 . Chr.15 : QTL:10991 , QTL:10988 . Chr.16 : QTL:11030 . Chr.17 : QTL:11055 . Chr.18 : QTL:11067 . Chr.19 : QTL:11091 , QTL:11087 , QTL:11078 , QTL:11073 . Chr.20 : QTL:11095 . Chr.21 : QTL:11117 . Chr.22 : QTL:11150 , QTL:11143 . Chr.23 : QTL:11170 . Chr.25 : QTL:11214 . Chr.26 : QTL:11225 . Chr.27 : QTL:11260 . Chr.28 : QTL:11279 , QTL:11276 . Chr.29 : QTL:11285 .
QTL for Calving ease reported for chromosome(s):
Chr.1 : QTL:10646 , QTL:10634 , QTL:10633 . Chr.2 : QTL:10667 , QTL:10662 . Chr.3 : QTL:10695 . Chr.4 : QTL:10721 , QTL:10713 , QTL:10703 . Chr.5 : QTL:10741 , QTL:10732 . Chr.6 : QTL:10769 , QTL:10764 , QTL:10759 . Chr.7 : QTL:10811 , QTL:10795 . Chr.8 : QTL:10839 , QTL:10838 , QTL:10833 , QTL:10831 . Chr.9 : QTL:10855 , QTL:10853 , QTL:10848 . Chr.10 : QTL:10870 , QTL:10871 . Chr.12 : QTL:10914 . Chr.14 : QTL:10959 , QTL:10958 , QTL:10956 . Chr.15 : QTL:11007 , QTL:11000 . Chr.16 : QTL:11029 , QTL:11015 . Chr.17 : QTL:11051 , QTL:11043 . Chr.19 : QTL:11092 , QTL:11081 . Chr.20 : QTL:11113 , QTL:11108 . Chr.21 : QTL:11131 , QTL:11126 . Chr.22 : QTL:11153 , QTL:11148 , QTL:11141 . Chr.23 : QTL:11167 , QTL:11158 . Chr.24 : QTL:11196 , QTL:11191 , QTL:11181 . Chr.25 : QTL:11208 , QTL:11204 . Chr.26 : QTL:11240 , QTL:11227 . Chr.27 : QTL:11259 . Chr.28 : QTL:11280 , QTL:11275 .
QTL/association Reported by chromosomes:
Chr.1 (25) ,
Chr.2 (20) ,
Chr.3 (28) ,
Chr.4 (19) ,
Chr.5 (32) ,
Chr.6 (26) ,
Chr.7 (36) ,
Chr.8 (27) ,
Chr.9 (21) ,
Chr.10 (20) ,
Chr.11 (30) ,
Chr.12 (21) ,
Chr.13 (17) ,
Chr.14 (27) ,
Chr.15 (29) ,
Chr.16 (29) ,
Chr.17 (20) ,
Chr.18 (13) ,
Chr.19 (24) ,
Chr.20 (20) ,
Chr.21 (22) ,
Chr.22 (21) ,
Chr.23 (24) ,
Chr.24 (20) ,
Chr.25 (18) ,
Chr.26 (24) ,
Chr.27 (20) ,
Chr.28 (19) ,
Chr.29 (20) .
Number of gene-based eQTL/associations: